Doc-O-Matic fügt automatisch Themen-IDs aus dem Dateinamen und den Überschriften der HTML-Datei ein. Wenn der Text der Überschrift oder der Datei einem Symbolnamen entspricht assoziiert Doc-O-Matic den Kommentar automatisch mit dem entsprechenden Symbol. 

Sie können auch das HTML-Themenidentifizierungszeichen verwenden, um eine Themen-ID einzufügen. Allerdings kann das Themenidentifizierungszeichen nur einmal pro HTML-Datei verwendet werden. In der Standardeinstellung ist das Themenidentifizierungszeichen folgendermaßen eingestellt:

wobei THE_SYMBOL_ID die Themen-ID des in dieser Datei beschriebenen Symbols ist. Im folgenden Beispiel wird Doc-O-Matic mitgeteilt, dass in der HTML-Datei eine Funktion mit dem Namen Control::Initialize, die einen Parameter vom Typ Parent hat, beschrieben wird.