Doc-O-Matic erzeugt automatisch eine Hierarchie für Symbole in Ihrem Sourcecode und gruppiert die Symbole in Verzeichnissen. In der Standardeinstellung ist die Symbolreferenz das übergeordnete Verzeichnis für alle Symbole. Es gibt verschiedene Möglichkeiten die Gruppierung der Symbole in der Hierarchie zu verändern.

• Sie können Module erzeugen und so Ihre Hierarchie unterteilen.
• Doc-O-Matic kann die Information von Namespaces verwenden und alle Symbole in einem Namespace als Unterthema des Namespaces gruppieren.
• Doc-O-Matic kann Ordner für Namespace und Module erzeugen.
• Sie können Doc-O-Matic so konfigurieren, dass es zusätzliche Ordner für Members und Ordner für verschiedene Methodenarten wie zum Beispiel Konstruktoren und Destruktoren erzeugt.
• Anstatt Members nach Typen zu sortieren, können Sie Members auch entsprechend Ihrer Sichtbarkeit wie zum Beispiel privat und öffentlich sortieren.
• Sie können Symbole alphabetisch oder nach der Position im Sourcecode sortieren.
• Sie können Verzeichnisse für Überladene Funktionen erstellen.